靶向代谢组学数据分析,靶向代谢组学数据分析方法

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维度靶向代谢组学非靶向代谢组学
目标预设代谢物绝对定量无偏筛查所有代谢物
灵敏度极高(飞摩尔级)相对较低
数据量少而精(数十~百种)海量(数千峰)
成本高(需标准品验证)较低
适用阶段机制验证/临床诊断初步筛查/标志物发现
表:根据911整理


💬 网友热评

  1. @科研小辣椒

    靶向代谢组学数据分析,靶向代谢组学数据分析方法


文章说明

靶向代谢组学数据分析,靶向代谢组学数据分析方法
  • @代谢圈扫地僧

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  • @医学生小鹿

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  • @数据控喵喵

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    GSG指数太实用了!导师说靶向数据才是肝病分型的金标准,比影像学更早预警🩺!5

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    1. 数据采集与优化
      • 使用三重四极杆质谱(LC-MS/MS) 搭配多反应监测(MRM)技术,通过优化碰撞能量获取最佳信号3;
      • 关键步骤:标准品验证→碎片离子筛选→建立MRM跃迁数据库310。
    2. 定量处理
      • 软件(如Analyst、Skyline)解析MRM谱图,生成代谢物浓度报告;
      • 引入内标校正(如同位素标记物),消除仪器波动误差5。
    3. 统计分析
      • 差异筛选:ANOVA分析组间浓度差异,结合火山图(Volcano plot)锁定显著代谢物610;
      • 模型验证:置换检验(Permutation test)防止过拟合,确保OPLS-DA模型可靠性6。
    4. 生物学解读
      • 通路富集分析(如KEGG):揭示代谢物关联的生物学通路(如三羧酸循环、胆汁酸代谢)5;
      • 临床关联:例如通过“GSG指数”(谷氨酸-丝氨酸-甘氨酸)评估非酒精性脂肪肝严重程度5。

    ▎应用场景:从实验室到临床

    • 疾病机制研究

      如短链脂肪酸(SCFAs)靶向分析揭示其抗炎、抗癌作用,及与肠道健康的关联2;

    • 生物标志物验证

      非靶向发现候选标志物→靶向技术大样本验证,提升诊断可靠性911;

    • 药物研发

      药效代谢物监测(如植物激素、黄酮类),加速药物活性评价5。

    ▎靶向 vs 非靶向:如何选择?

    • 高特异性:仅针对目标代谢物(如某通路中的氨基酸、胆汁酸等)检测,排除无关干扰29;
    • 高灵敏度:可检测飞摩尔(fmol)级浓度,适合低丰度代谢物分析3;
    • 绝对定量:依赖标准品建立校准曲线,实现浓度精准计算(如μg/mL)35。

    ▎数据分析全流程四步走

    • 技术细节参考代谢组学实验标准流程35;
    • 应用案例源自临床研究25;
    • 对比分析基于多平台数据911。

    以下是根据搜索结果整理的靶向代谢组学数据分析主题文章,结合技术要点与应用案例,以小红书风格呈现,并附网友模拟评论:

    💡 靶向代谢组学:精准解码生命代谢密码

    ▎技术优势:精准定量的“代谢侦探”

    靶向代谢组学(Targeted Metabolomics)是代谢组学研究的核心分支,专注于特定代谢物的绝对定量分析🔍。与非靶向代谢组学相比,其优势在于:

    相关问答


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    答:

    高通量靶向代谢组检测技术结合非靶向与

    靶向代谢组学

    优势,实现大批量、低丰度代谢物高效检测,提供定性、定量

    分析

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